RAD-Seq 簡化基因組定序 產品簡介
基於酶切的簡化基因組測序(RAD-seq,Restriction-site Associated DNA Sequence)指利用限制性內切酶對基因組進行酶切,大幅降低基因組的複雜度,對特定長度的酶切片段(RAD-tag )進行高通量測序,快速鑑定高準確性的變異標記(SNPs)信息,進行群體進化、遺傳圖譜構建、QTL定位及輔助scaffold組裝到染色體等分析。該技術操作簡單、不受參考基因組限制;基於SNPs的分子標記技術性價比高,穩定性好,特別適合大樣本量的分析。目前已廣泛應用於分子育種、系統進化、種質資源鑑定等領域。
標準分析
1)去除接頭污染和低質量數據; 2)比對到參考基因組; 3)產出數據統計; 4)SNP檢測、註釋及統計; 5)InDel檢測、註釋及統計; 6)SV檢測、註釋及統計。 |
高級分析
1)基因分型; 2)遺傳圖譜構建; 3)QTL定位(需提供表型數據); 4)遺傳圖譜整合(需提供同一作圖群體原圖譜數據)。 |
樣品要求
1)樣品類型:無降解且無RNA污染的DNA樣品;
2)樣品需求量:≥2μg;
3)樣品濃度:≥25 ng/μl;
4)樣品純度:OD260/280=1.8~2.0;
5)推薦樣本大小:遺傳圖譜構建>100,群體進化>30。
1)樣品類型:無降解且無RNA污染的DNA樣品;
2)樣品需求量:≥2μg;
3)樣品濃度:≥25 ng/μl;
4)樣品純度:OD260/280=1.8~2.0;
5)推薦樣本大小:遺傳圖譜構建>100,群體進化>30。