Metagenome 指特定生活環境中全部微小生物遺傳物質的總和, 它包含了可培養的和未可培養的微生物的基因, 目前主要指環境樣品中的細菌和真菌的基因組總和。通常可以利用細菌的16S或真菌的18S rDNA鑑定出在樣品當中組成的群落種類與數量,這是因為在16S或18S rDNA中具有一些高度變異序列的區域,我們可以將這些特定區域序列視為代表該菌種的Tag,透過NGS大量獲得Tag資訊後再利用相似度將序列分群,我們稱之為OTU (Operational Taxonomic Units)分析,將序列與資料庫進行比對後,就可以獲得該樣品中菌種的組成與數量之概況。
力鈞生物Metagenome測序服務樣品要求
樣品要求 DNA
1) 樣品純度:OD 260/280值應在1.8~2.0 之間。
2) 樣品總量:每個樣品總量不少於1 µg。
3) 樣品溶劑:建議溶解在H2O或TE (pH 8.0)中。
樣品要求 DNA
1) 樣品純度:OD 260/280值應在1.8~2.0 之間。
2) 樣品總量:每個樣品總量不少於1 µg。
3) 樣品溶劑:建議溶解在H2O或TE (pH 8.0)中。